商务部副特派员是商务部特派员体系中的一种级别，通常属于高级职务。商务部特派员是商务部向国内外派遣的专业人才，负责推进我国对外经济贸易合作，促进我国国际经济合作与交流。商务部副特派员则是商务部特派员体系中的高级副职级别，通常负责领导、管理、指导和协调商务部特派员工作，具有较高的管理和指导职责。

商务部副特派员的主要工作是协助商务部特派员完成对外经济贸易合作任务，具体包括：参与制定对外经济贸易政策，推进对外贸易谈判，开展经贸投资促进活动，促进国际经济技术交流与合作，提供对外经济贸易信息等。同时，商务部副特派员还要负责管理和指导商务部特派员的工作，确保其工作顺利进行，达到预期目标。

总的来说，商务部副特派员是商务部特派员体系中的高级职务，具有较高的管理和指导职责，负责协助商务部特派员完成对外经济贸易合作任务，推动我国对外经济交流与合作。