《神医侠侣》是一部充满惊险刺激的古代言情小说，讲述了神医秦岭和侠女秦婉儿之间的爱情故事，以及他们在皇宫中的种种遭遇。在小说的结局中，皇上和太后的命运也有了意想不到的转变。

在小说的前半部分，皇上一直是一个残暴而冷酷的人，对待臣民和妃嫔都是毫不留情的。然而，在与秦岭的交往中，他逐渐开始改变，变得更加温和、宽容。他也开始对太后产生了真正的感情，而太后也在他的影响下变得更加睿智、善良。

但是，他们的命运却受到了一系列的阻挠和挑战。首先是太后的生命受到了威胁，而秦岭需要前往远方寻找灵药来挽救她的生命。在他离开的时候，皇上和太后的感情受到了考验，但他们还是相互扶持，一起度过了这段难关。

然而，真正的考验还在后面。皇上和太后的王位受到了威胁，他们被迫离开了皇宫，四处逃亡。在这个过程中，他们遇到了许多危险和艰难，但他们始终相互支持，坚定地走下去。

最终，他们成功地摆脱了敌人的追杀，回到了皇宫。在这里，他们不仅成功地保住了王位，还让整个国家变得更加富强、稳定。皇上和太后也在这个过程中变得更加坚强和勇敢，他们的感情也变得更加深厚。

《神医侠侣》的结局充满了希望和美好。皇上和太后也在这个过程中变得更加睿智、善良，成为了一个更好的统治者。他们的爱情也经过了无数的考验，变得更加坚固和真实。这个结局让读者感到欣慰和满意，也让人们相信，在困难面前，只要相互扶持，就一定能够走过难关。