近年来，我国税收政策不断调整，不同收入层次的纳税人缴纳的个税也有所不同。对于年收入25万元的纳税人来说，应该如何计算扣除个人所得税呢？

首先，我们需要了解个人所得税的计算方式。根据我国现行个税法规定，个人所得税的计算公式为：应纳税所得额 = 工资薪金所得额 - 个人所得税起征点 - 专项扣除 - 社保公积金等法定扣除项。其中，个人所得税起征点为5000元，也就是说，只有当工资薪金所得额超过5000元时，才需要缴纳个人所得税。

对于年收入25万元的纳税人来说，其工资薪金所得额为25万元，超过了个人所得税起征点，因此需要缴纳个人所得税。那么，具体需要缴纳多少个人所得税呢？

根据个人所得税的计算公式，我们可以得到：应纳税所得额 = 25万元 - 5000元 - 专项扣除 - 社保公积金等法定扣除项。其中，专项扣除包括子女教育、继续教育、住房租金、赡养老人等，可以根据实际情况进行申报。社保公积金等法定扣除项则是根据所在地区的具体规定而定。

假设年收入25万元的纳税人专项扣除为1万元，社保公积金等法定扣除项为5000元，则其应纳税所得额为：25万元 - 5000元 - 1万元 - 5000元 = 18万元。根据我国个人所得税的税率表，年收入18万元的纳税人需要缴纳个人所得税3640元。

综上所述，年收入25万元的纳税人需要缴纳个人所得税的具体金额，是根据其工资薪金所得额、专项扣除、社保公积金等法定扣除项等因素而定。纳税人可以根据实际情况进行申报，以减少个人所得税的缴纳金额。