发票勾选认证是在税务局的电子税务局系统中进行的。在该系统中，纳税人可以通过网上申报功能进行发票的勾选认证。具体操作步骤如下：

1. 登录电子税务局系统，进入网上申报功能页面。

2. 在网上申报功能页面中选择“增值税申报”选项。

3. 选择需要勾选认证的发票类型，包括专用发票、普通发票等。

4. 在发票勾选认证页面中，输入发票号码、发票代码等相关信息，并勾选认证需要的发票。

5. 点击“确定”按钮，系统会自动进行勾选认证操作，并生成相应的认证记录。

需要注意的是，在进行发票勾选认证操作前，纳税人需要确保已经完成了相关的税务登记和纳税申报工作，否则将无法进行该操作。另外，纳税人在进行发票勾选认证操作时，也需要遵守相关的税务法规和规定，确保申报信息的真实性和准确性。